Witam!
Do html i css znam fajną stronę sam się z niej uczyłem:
http://www.kurshtml.boo.pl/
Do php:
http://phpkurs.pl/
A co do mysql to w php my admin jest prosta obsługa bez znajomości tego języka. Po długim użytkowaniu samo wchodzi do głowy.
Z programów polecam xampp i PSPad lub jeżeli trochę zainwestujesz to dobry jest Adobe Dreamweaver CS4.
Pozdrawiam!